Abhängigkeits-Netzwerk
English version
Das Abhängigkeits-Netzwerk veranschaulicht statistische Korrelationen zwischen
Rearrangements. Positive Korrelationen (d.h. Rearrangements ereigneten sich
häufiger gemeinsam als von ihren Randverteilungen zu erwarten wäre) werden mit
blauen Linien dargestellt, wohingegen negative Korrelationen (d.h.
Rearrangements ereigneten sich seltener gemeinsam als von ihren
Randverteilungen zu erwarten wäre)mit roten Linien dargestellt werden; je
dicker die Linien, desto (statistisch) verläßlicher ist die Korrelation.
Weitere statistische Daten werden in Tabellen dargestellt: die Häufigkeit der
Ereignisse, die Häufigkeit von Kombinationen vin Ereignissen (Support ),
der Vierfelder-Korrelations-Koefficient
Phi , Pearson's
Kontingenz-Koefficient ,
Odds Ratio ,
zugeordnetes Risiko (Attributable Risk ), und der
chi-Quadrat-Wert , der Hinweise auf die Signifikanz der Korrelation
gibt.
Geben Sie die Datei mit den zu analysierenden Daten samt zugehörigem Datenformat
ein, wählen Sie die Art der Daten-Vorverarbeitung, die maximale Anzahl zu
analysierender Fälle, die Anzahl der darzustellenden Rearrangements und den
Schwellenwert für die Signifikanz.
Mögliche Datenformate sind das Format der Mitelman-Datenbank, oder ein sehr
einfaches Sonderformat, das nur die Fall-Identifikation und den Karyotyp
beinhaltet, die voneinander mit einem Tabulator oder einem anderen Trennzeichen
getrennt sind, mit einem Fall pro Zeile; dieses Format ist auch an die CGH
angepaßt worden. Zusätzliche Information erhalten Sie im "HowTo
zu Datenformaten ."
Wenn Sie nicht damit vertraut sind, wie Sie Daten aus der Mitelman-Datenbank
erhalten können, lesen Sie bitte die kurze Beschreibung "Retrieving
data from the Mitelman database " (nur in englischer Sprache).
Beachten Sie bitte auch, daß manche Daten in der
Mitelman-Datenbank eine ältere Version der ISCN als die ISCN 1995 verwenden.
Solche Daten können noch kompatibel mit der ISCN 1995 sein und werden somit
korrekt analysiert, aber manche Daten könnten bereits inkompatibel sein und
daher fehlerhaft ausgewertet werden.
Daten können verarbeitet werden "wie beschaffen" (d.h. ohne Vor-Verarbeitung),
oder sie können zuvor in SCCN oder in Zytoband-Daten übersetzt werden; in den
letzteren Fällen können Sie auch die virtuelle Banden-Auflösung der
verarbeiteten Daten angeben.
Weitere Info zum Abhängigkeits-Netzwerk erhalten Sie in der
Beschreibung der Desktop-Version und der
Berechnung der Daten (jeweils in englischer Sprache).
Parameter
Datei:
Format:
Nur für die Sonderformate:
Trennzeichen:
Kopfzeile ist vorhanden
Daten-Vorverarbeitung:
Verwende die Daten
oder übersetze sie in
mit einer Auflösung von
Anzahl der Fälle:
Die maximale Anzahl von analysierbaren Fällen ist aus technischen Gründen (Dauer
der Berechnung) auf den unten angegebenen Wert begrenzt. Sie können auch einen
noch geringeren Wert wählen.
Beachten Sie dabei, daß sinnvolle Ergebnisse mit weniger als 100 Fällen kaum
erreicht werden können.
Weitere Analyseparameter:
Anzahl der darzustellenden Rearrangements:
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
Minimaler chi-Quadrat-Wert für die Darstellung von Korrelationen:
3
4
5
7
10
14
20
30
